1969年,赴黑龙江生产建设兵团务农;
1975年,转到河北省围场县;
1978年,考入河北大学经济系;
1982年,考入中国社会科学院研究生系主攻西方经济学;
1985年,毕业获硕士学位后,又继续考取博士研究生,6年间从师朱绍文教授,学习西方经济学专业;
在攻读博士学位期间,于1985-1987年期间赴美国哈佛大学及国民经济研究局学习研究,系统地学习了哈佛大学经济系研究生的专业课程;
1988年,获中国社科院经济学博士学位。同年进入中国社会科学院经济研究所工作;
1992年,晋格为中国社会科学院研究员,被评为国家级有突出贡献的中青年专家;
1992至1993年,任《经济研究》编辑部主任;
1994至1995年,任经济研究所副所长;
1995至今,任中国经济改革研究基金会理事长及法人代表;
2006年至2010年,樊纲任中央货币政策委员会委员;
2012年,担任综合开发研究院理事会副理事长,院长;
2015年6月,再次入选央行货币政策委员会。
任中国经济体制改革研究会副会长,中国改革研究基金会理事长,国民经济研究所所长,中国(深圳)综合开发研究院院长。兼北京大学、南开大学、中国社会科学院研究生院经济学教授、汇名家网特约讲师。
1991年和2005年,获孙冶方经济学优秀论文奖;
1992年,被破格晋格为中国社会科学院研究员,被评为国家级有突出贡献的中青年专家;
2004年,被法国奥弗涅大学授予名誉博士;
2015年10月26日,中国经济理论界的最高奖——中国经济理论创新奖揭晓:以林毅夫研究组、张军、樊纲为主要贡献人的过渡经济学理论,高票获得第七届中国经济理论创新奖。