对通过国家级高企认定的企业，市级财政给予一次性奖励10万元，各区级财政还将给予10万元-25万元不等的一次性奖励。首次备案为市级高企市财政给予一次性奖励5万元，区级财政还给予一次性奖励10万元。2017年仅市级财政就兑现两级高企一次性补贴超1.1亿元。此外，企业还可申请研发经费补助，每年每家企业补助额度最高可达到250万元。

高新技术企业是指：在《国家重点支持的高新技术领域》内，持续进行研究开发与技术成果转化，形成企业核心自主知识产权，并以此为基础开展经营活动，在中国境内(不包括港、澳、台地区)注册的居民企业。
厦门高新技术企业认定条件
（一）企业需具有独立法人资格、独立经营场所，申请备案时在厦门市注册成立满一年以上；
（二）企业通过自主研发、受让、受赠、并购等方式，获得对其主要产品（服务）在技术上发挥核心支持作用的知识产权的所有权，企业申报前拥有I类自主知识产权1项（含）以上或申报前三年内拥有II类自主知识产权2项（含）以上；
（三）对企业主要产品（服务）发挥核心支持作用的技术属于《国家重点支持的高新技术领域》规定的范围；
（四）企业从事研发和相关技术创新活动的科技人员占企业当年职工总数的比例不低于10%，近一年缴交社会保险或个人所得税超过6个月（含）的职工不少于5人；
（五） 近一年销售收入一般不低于50万元且不高于2亿元，若低于50万元的，其近一年研究开发费用总额不低于50万元；
（六）近一年的研究开发费用总额占同期销售收入总额的比例不低于3%；
（七）近一年高新技术产品（服务）收入占企业同期总收入的比例不低于50%；
（八）企业申请备案前一年内未发生重大安全、重大质量事故或严重环境违法行为。
提交材料
1.市级高新技术企业备案申请书；
2.知识产权相关材料；
3.企业职工和科技人员情况说明材料；
4.经具有资质的中介机构出具的企业近一个会计年度研究开发费用和高新技术产品（服务）收入专审报告或鉴证报告；
5.经具有资质的中介机构鉴证的企业近一个会计年度的财务会计报告；
6.近一个会计年度企业所得税年度纳税申报表。