从2019长三角创新机构排行榜的主体类型看，百强机构中高等院校数量约占3/5，科研机构约占2/5。其中发明总量排名前十的机构均为大学，科研院所则在专利授权率、全球化以及影响力方面的表现更为优异。国家级高校院所创新优势更加凸显，在第一梯级的25家机构中，国家级机构占22席。

长三角机构创新100强名单里，上海机构有32家，第一梯级25家机构中，上海有11家，占比最高；江苏机构总数最多，达到39家，浙江机构有20家，安徽机构有9家。上海第一梯级机构的数量居首位，在全球化、影响力等指标上表现突出，在重点行业领域具有较强的集聚度，区位发展综合优势突出；江苏各梯级机构数量分布均衡，区域集聚度有待提升；浙江在机构发明总量上占据优势，在专用设备、计算机领域表现突出；安徽省虽然总量不高，但在一些主导方向上特色明显。